Masteronderzoek Oncologische Chirurgie: Pathomics Rectum

Validatie van een AI gebaseerde marker voor de selectie van stadium II/III endeldarmkankerpatiënten met een slechte prognose die mogelijk baat hebben bij adjuvante chemotherapie.

Studeer jij Geneeskunde (bachelor of master) en heb je interesse in wetenschappelijk onderzoek? Of ben je op zoek naar een plek voor je (master)onderzoek? Dan is dit een mooie kans!

Achtergrond
Vanwege gebrek aan voldoende bewijs is adjuvante chemotherapie na een curatieve resectie geen standaardbehandeling bij het rectumcarcinoom in Nederland. Dit resulteert in een unieke database wereldwijd; de meerderheid van de patiënten wordt niet behandeld met adjuvante chemotherapie. Ondanks recente vooruitgangen in behandelingen komt een recidief nog steeds voor bij ongeveer 30% van de patiënten, wat verband houdt met een slechte prognose. Dit benadrukt het feit dat een grote groep patiënten niet gecureerd is na chirurgie alleen. Adjuvante chemotherapie kan van toegevoegde waarde zijn voor een specifieke subgroep van patiënten met een vermoedelijk slechte prognose op basis van hun tumorkenmerken. Onlangs is een op deep learning gebaseerde biomarker ontwikkeld die uitstekende voorspellingen van patiëntuitkomsten kan maken op basis van digitale pathologiebeelden van de primaire colorectale tumor. Omdat het rectumcarcinoom op zichzelf een specifieke tumorbiologie heeft, is het belangrijk om dit model te testen in een grote groep bestaande uit alleen patiënten met een rectumcarcinoom, om de veelbelovende potentiële waarde van deze op deep learning gebaseerde biomarker verder te onderzoeken. Dit kan uiteindelijk helpen bij het selecteren van patiënten met een slechte prognose voor behandeling met adjuvante chemotherapie.

Onderzoeksvraag
Het doel van deze studie is om een AI model te valideren om de prognose van een patiënt te voorspellen op basis van de H&E coupe van het resectiepreparaat van de primaire rectumtumor.

Werkzaamheden student

• Je onderhoudt via de PALGA-portal contact met pathologiecentra. Daarnaast sorteer en verwerk je de binnengekomen coupes.

• Je werkt met bestaande databases uit de Snapshot Rectum 2011 en 2016 studies en selecteert relevante variabelen voor dit project. Indien nodig vul je de database aan op basis van pathologieverslagen.

• Je voert descriptieve analyses uit op de patiëntgegevens van de subgroep die geselecteerd is voor het onderzoek met de AI-marker. In overleg kun je ook aanvullende analyses uitvoeren, zoals survival-analyses, op basis van de beschikbare variabelen. Er is volop ruimte voor eigen analytische inbreng!

Wie zoeken wij?
Wij zoeken een gemotiveerde geneeskundestudent die zowel organisatorisch als analytisch sterk is. Je taken variëren van contact met pathologiecentra tot databasebeheer en data-analyse. Je denkt mee over de praktische uitvoering en draagt bij aan de organisatie van het project.

Wij zoeken iemand die:

• Secuur en gestructureerd werkt

• Graag organiseert en overzicht bewaart

• Zelfstandig werkt en initiatief neemt

• Affiniteit heeft met data

• Proactief en leergierig is

• Zorgvuldig omgaat met patiëntmateriaal en vertrouwelijke gegevens

Startdatum

• In overleg, bij voorkeur zo snel mogelijk.

Wat bieden wij?
Je wordt intensief begeleid door een enthousiaste arts-onderzoeker, met wekelijkse voortgangsbesprekingen. Je neemt deel aan wetenschapsmeetings en er is in overleg de mogelijkheid om een dagje mee te lopen op de polikliniek en/of OK.

Aanmeldingsprocedure
Ben je geïnteresseerd of heb je vragen? Neem dan vooral contact op met Mirthe Ubink via m.ubink@erasmusmc.nl.